Erreur 500 sur script .pl

[pagesjaunes312]

Je crois avoir trouvé quelque chose qui fonctionne
Lorsque, je passe par WinSCP via SSH et j'ai toujours mon erreur 500
Si j'upload mon fichier via FileZilla en FTP, là l'erreur disparait.

Je me dis que c'est un pb de propriétaire de fichier, alors je retente en SSH (je suis en root), j'upload mon fichier puis fais un chmod 755 et un chown avec le nom du propriétaire de mon répertoire. Mais ça ne fonctionne pas non plus !

Pour l'instant, j'upload donc en FTP, mais ca ne fonctionne pas pour les répertoires cgi-bin qui n'apparaissent dans aucun FTP hélas !

Sauriez-vous d'où ça pourrait venir ?
Merci pour vos réponses...