Провлемы с оперативкой

[data-stream_ru]

Ну во первых, тема офф-топик - к панели отношения не имеет. Её демоны ни чего практически не потребляют.

Во вторых, основной пожиратель памяти 2-й апач и его дохлые процессы-зомби и всё прочее. Надо нормально конфигурировать апач и более того, делать greiseful restart (не помню точно - "любезная перезагрузка" без отрубания активных сессий) раз в час по крону. И полная перезагрузка раз в сутки.
Смотрим здесь - http://main.data-stream.ru/check_sys/
Логин/пароль demo|demo

Смотрим использование памяти. На графики характерная пила. Так вот снижение потребления как раз после перезагрузки и убийства подвешенных процессов.

Далее, судя по использованию системы у вас в топе висят прежде всего пхп скрипты.
Так вот я как то столкнулся с траблом галимого пхп.
Каталожный двиг который я разрабатываю, и который на порядок легче любого портала в некоторых версиях стал неоправданно много пожирать системных ресурсов.
Как потом выяснилось, проблема была в ошибки кеширования страниц обратных ссылок - запись в несуществующую директорию или запись в директорию с недопустимой записью.
perl в этом случае просто вылетел бы в ошибку, а пхп как сизиф пытается записать всё время отпущенное на процесс.
Так вот, ВПС при этом едва ли не падал.

Так что включайте в план исследований ещё и ревизию движков и скриптов.