Одно другого не отменяет... Я только подправил исходники hcrond, чтобы fork'и имели правильных владельцев. Т.е. подкорректировал работу самого демона, все стальное - по инструкции, которая, кстати, для 1.0.7 слегка не актуальна. Особенно для debian-based дистрибутивов, в которых chkconfig просто нету и немного другая процедура запуска инит-скриптов (для squeeze вообще не надо делать симлинков в каталогах rcX.d, а надо править файл /etc/runlevels.conf).
Т.е. сначала ставим по инструкции, потом подменяем уже моим вариантом - самый простой путь. Я еще не готов выложить всю сборку. PHP скрипты пришлось не подправить, а по большей части переписать... Увы, я не Шива и руки у меня всего 2
И свой хостинг тоже надо подымать, а то сервак уже неделю прозябает на техплощадке без дела.