Modification d'iscCP RC3 et future update

[Spheerys]

Après avoir longtemps utilisé VHCS et en avoir bavé à chaque problème exotique pour le résoudre (support qui semble moins réactif qu'ici), je me suis décidé à utiliser ispCF Omega même si il est encore en RC3
Quelle bonne surprise ! Design plus moderne, sécurité accrue dès le départ, petites améliorations bien pensées.... bref que du bonheur

J'ai donc commencé à passer quelques petits sites en production (vi, c'est dangeureux ) mais ça me permet aussi de faire remonter quelques bugs éventuels.

La question que je me pose, c'est comment va se passer les upgrades des prochaines versions (finales et suivantes).
Car j'ai fait quelques modifs mineures dans le fichier /var/www/ispcp/gui/include/ispcp-lib.php (principalement) et je voulais savoir si je devais m'attendre à le voir écrasé par une version plus à jour lors d'un update ?
Quid des diverses améliorations possible qu'on trouve sur le site d'ispCF, comme les astuces pour le rendre plus sécure ou encore l'installation de RoundCube (par exemple) ?

En résumé : pour éviter un maximum les problème lors des prochaines MAJ, est-il préférable de garder ispCP le plus intact possible ou le processus de migration tiendra-t-il compte de l'existant sans problème ?