Donde se carga Un Script Alias

[kurgans]

Haz enlaces a
:/usr/lib/php5/20060613
Es donde estan las libs de php de las nuevas libs

Aqui estan los ini si tienes algun ini en lo que has instalado nuevo pero no lo creo
/etc/php5/conf.d

Y quita extension_dir para que vaya por defecto a esas rutas, o hazlo a reves los enlaces los pasas a usr/bin, y dejas el extension_dir pero tienes que jugar con lo que tienes + lo nuevo

Yo recuerdo que cuando lo monte me dio tambien algunos quebraderos de cabeza,